本书将微生物学实验分为基础实验、综合提高实验和研究创新实验三个阶段。基础实验21个，以研究课题的形式安排实验内容和顺序，使所有的基础实验连贯成一个科学探究课题，编写主线为： 培养基的配制及灭菌；土壤四大类微生物的培养计数、分离纯化；分离放线菌、酵母菌和霉菌的形态鉴定； 分离细菌的形态鉴定、生长曲线、营养需求、生长控制、生理生化特征、16S rDNA鉴定； 微生物菌种保藏。综合提高实验16个，分别是与农业、环境、食品、医药相关的小型研究课题。研究创新实验示例1个。